Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms