Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ACTA1P68133 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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