Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SUMO1P63165 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms