Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms