Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP7P55210 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP7P55210 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP7P55210 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP7P55210 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP7P55210 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP7P55210 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP7P55210 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP7P55210 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP7P55210 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP7P55210 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP7P55210 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP7P55210 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP7P55210 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP7P55210 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP7P55210 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP7P55210 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP7P55210 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP7P55210 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP7P55210 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP7P55210 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP7P55210 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP7P55210 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP7P55210 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP7P55210 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP7P55210 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP7P55210 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP7P55210 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP7P55210 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP7P55210 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP7P55210 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP7P55210 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP7P55210 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP7P55210 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP7P55210 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP7P55210 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms