Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAD23AP54725 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms