Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB3P54284 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms