Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC3P51654 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC3P51654 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms