Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA4P51532 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms