Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 MED25-209ENST00000612791 881 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC241585.2-202ENST00000621798 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ATRXP46100 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ATRXP46100 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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