Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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HOXA13P31271 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA13P31271 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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HOXA13P31271 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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