Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FGFR4P22455 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms