Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDCP19113 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDCP19113 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDCP19113 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms