Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms