Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEFHP12036 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEFHP12036 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEFHP12036 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEFHP12036 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEFHP12036 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEFHP12036 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEFHP12036 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEFHP12036 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEFHP12036 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms