Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 AC126474.1-201ENST00000623555 1293 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PYGBP11216 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 GPR15-201ENST00000284311 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 ING3-202ENST00000339121 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 LINC00992-201ENST00000504107 617 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 ARL1-203ENST00000539055 1231 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 AC007494.2-201ENST00000563757 764 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 AC090371.1-201ENST00000580071 558 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 AL121929.2-201ENST00000609691 1432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PYGBP11216 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYGBP11216 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYGBP11216 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYGBP11216 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYGBP11216 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYGBP11216 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYGBP11216 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYGBP11216 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PYGBP11216 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYGBP11216 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYGBP11216 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYGBP11216 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYGBP11216 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYGBP11216 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYGBP11216 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PYGBP11216 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms