Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSTPIP1O43586 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms