Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 PIGO-202ENST00000361778 2464 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLGNO14967 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLGNO14967 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLGNO14967 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLGNO14967 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLGNO14967 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLGNO14967 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLGNO14967 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLGNO14967 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLGNO14967 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLGNO14967 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLGNO14967 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.9 ms