Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 MYO7A-201ENST00000409619 7106 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms