Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD54BQ9Y620 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms