Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms