Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARHGAP28Q9P2N2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARHGAP28Q9P2N2 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARHGAP28Q9P2N2 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
ARHGAP28Q9P2N2 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms