Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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SH3BP4Q9P0V3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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SH3BP4Q9P0V3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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SH3BP4Q9P0V3 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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SH3BP4Q9P0V3 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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SH3BP4Q9P0V3 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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SH3BP4Q9P0V3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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SH3BP4Q9P0V3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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SH3BP4Q9P0V3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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SH3BP4Q9P0V3 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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