Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST12Q9NRB3 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms