Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RAB18Q9NP72 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms