Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHACTR1Q9C0D0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHACTR1Q9C0D0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms