Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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