Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
UPK3BQ9BT76 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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