Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGMNQ99538 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms