Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZA3Q96KX2 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms