Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLDN23Q96B33 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLDN23Q96B33 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLDN23Q96B33 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLDN23Q96B33 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLDN23Q96B33 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLDN23Q96B33 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLDN23Q96B33 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLDN23Q96B33 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CLDN23Q96B33 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CLDN23Q96B33 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CLDN23Q96B33 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CLDN23Q96B33 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN23Q96B33 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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