Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX21Q969T3 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX21Q969T3 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX21Q969T3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX21Q969T3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX21Q969T3 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX21Q969T3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX21Q969T3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX21Q969T3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX21Q969T3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX21Q969T3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX21Q969T3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX21Q969T3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX21Q969T3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX21Q969T3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX21Q969T3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX21Q969T3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX21Q969T3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX21Q969T3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX21Q969T3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX21Q969T3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX21Q969T3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX21Q969T3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX21Q969T3 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX21Q969T3 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX21Q969T3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX21Q969T3 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX21Q969T3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX21Q969T3 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms