Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBA3Q8TBC4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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