Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC112Q8NEF3 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms