Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS8Q8N3P4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms