Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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