Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms