Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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USP43Q70EL4 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP43Q70EL4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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