Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms