Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC091170.1-201ENST00000582983 2190 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 LINC-PINT-208ENST00000451786 3505 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 325.8 ms