Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms