Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms