Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RFTN2Q52LD8 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms