Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTXN3Q4LDR2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms