Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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