Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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