Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CACNA1C-207ENST00000399597 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CACNA1C-208ENST00000399601 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CACNA1C-217ENST00000399641 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CACNA1C-218ENST00000399644 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CLINT1-206ENST00000523094 3987 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 IKZF4-202ENST00000431367 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ESPL1-201ENST00000257934 6623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 NLRC5-203ENST00000436936 6724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 WNK1-204ENST00000530271 11804 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AP000350.6-201ENST00000609510 5637 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 VDR-202ENST00000395324 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 TACC1-201ENST00000276520 6513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 RNF170-206ENST00000527424 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 TBC1D29-202ENST00000580161 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 ANXA11-202ENST00000372231 6720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 RIMS2-207ENST00000504942 4228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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VAMP3Q15836 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 STRA6-204ENST00000423167 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 MAP1A-201ENST00000300231 10258 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VAMP3Q15836 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AC093525.7-201ENST00000569852 3626 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 NFXL1-202ENST00000381538 3728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ZIC4-217ENST00000525172 4152 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 MTUS2-206ENST00000612955 7430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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