Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SYCP1Q15431 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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SYCP1Q15431 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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SYCP1Q15431 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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SYCP1Q15431 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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SYCP1Q15431 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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SYCP1Q15431 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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SYCP1Q15431 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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SYCP1Q15431 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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SYCP1Q15431 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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