Protein–RNA interactions for Protein: Q14289

PTK2B, Protein-tyrosine kinase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2BQ14289 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTK2BQ14289 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms