Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ATP1A4Q13733 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ATP1A4Q13733 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ATP1A4Q13733 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATP1A4Q13733 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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